Estão previstas, entre as principais atividades do instituto, a criação de um programa de pós-graduação stricto sensu, que constituiria em um doutorado em Estudos Europeus, e também em cursos de especialização lato sensu, nas áreas de humanidades e artes, ciências, tecnologia, saúde, biologia e política.
O projeto também abrange uma biblioteca digital e a organização de workshops, congressos e fóruns de discussão. A USP será a responsável por administrar e implantar o instituto, mas deve contar com a parceria da Unesp, Unicamp e de mais cinco universidades federais, além da associação de diversas instituições e universidades pertencentes à União Europeia.